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12 août

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Recherche & Stages

Le M2 Microbiologie Moléculaire de Toulouse s’appuie sur un solide tissu local de recherche en Microbiologie. Cela représente une trentaine d'équipes d'accueil (EAD) réparties sur plusieurs sites toulousains (Université Paul Sabatier, INSA, CNRS, INRA, Ecole Vétérinaire, laboratoires hospitaliers, ENSTIMAC), soit environ 75 HDR (Habilitation à diriger les recherches)  qui participent activement à la formation. 

 

Laboratoires d’appui labellisés : 

Centre de Biologie Intégrative - Toulouse (CBI)
http://cbi-toulouse.fr/fr/
 

Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaire (LMGM)

https://www-lmgm.biotoul.fr/

Laboratoire de Biologie Moléculaire des Eucaryote (LBME)

https://www-lbme.biotoul.fr/

 

Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes (LIPM) 

http://www6.toulouse.inra.fr/lipm

 

Institut de Pharmacologie et Biologie Structurale (IPBS) 

http://www.ipbs.fr/

 

Laboratoire Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP)
http://www.lisbp.fr/fr/index.html

 

Laboratoire de Sciences Végétales (LRSV) 

https://www.lrsv.ups-tlse.fr/

 

Ecole Nationale Vétérinaire (ENVT)

http://www.envt.fr/menu-og-32/recherche.

 

Centre de Physiopathologie de Toulouse (CPTP) 

http://www.cptp.inserm.fr/

 

Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD)

http://www.irsd.fr

 



Informations complémentaires

Liste des stages proposés pour l'année 2019-2020

Reconstitution d'une cible thérapeutique chez Mycobacterium tuberculosis, le complexe Fatty Acid Synthase-II.
Fabienne Bardou et Annaïk Quémard (IPBS, Toulouse)

Etude de la réponse de Mycobacterium smegmatis au stress hypoxique au sein du macrophage
Yannick Poquet et Florence Levillain (IPBS, Toulouse)

Bases moléculaires de l’adaptation à la symbiose au cours de l’évolution expérimentale des rhizobia
Delphine Capela (LIPM, Toulouse)

Caractérisation des nouveaux systèmes TACX (Toxine-Antitoxine dépendant de ClpX) chez Escherichia coli
Patricia Bordes (CBI-LMGM, Toulouse)

Caractérisation des voies de régulation et du rôle de l’Hémolysine F chez les Escherichia coli pathogènes Extra-intestinaux (ExPEC)
Priscilla Branchu (IRSD, Toulouse)

Deux projets sont proposés et concernent les systèmes toxine-antitoxine ou la persistance aux antibiotiques
Laurence Van Melderen (ULB, Bruxelle, Belgique)

Conjugaison bactérienne dans le microbiome intestinal de C. elegans
Cathy Guynet et A. Pérez Escudero (CBI-LMGM-CRCA, Toulouse)

Impact de la colibactine produite par des souches de Escherichia coli uropathogènes sur les mastocytes et la réponse précoce à l’infection urinaire
Jean-Philippe Nougayrède (IRSD, Toulouse)

Identification de protéines impliquées dans l’export des lipides d’enveloppe chez les mycobactéries
Manuelle Ducoux-Petit (IPBS, Toulouse)
Organisation de la capsule Mycobacterium tuberculosis : Complexation de l’-glucane avec des lipides et des antibiotiques
Anne Lemassu (IPBS, Toulouse)

Criblage d’antagonistes de la Protéine-O-mannosyltransférase de Mycobacterium tuberculosis, pour la recherche de composés anti-tuberculeux de nouvelle génération
Emeline Fabre et Michel Rivière (IPBS, Toulouse)

Le biologie des ARN chez les Archées: Caractérisation biochimique d’une nouvelle ribonucléase putative, RecJSOD, appartenant au réseau d’interaction du complexe aRNase J/ hélicase ASH-Ski2 chez les Thermococcales
Béatrice Clouet-d’Orval & Marie Bouvier (CBI-LMGM, Toulouse)

Etude génétique de l'ARN Polymérase I de Saccharomyces cerevisiae
Olivier Gadal (CBI-LBME, Toulouse)

Etude de la production des bioplastiques (polyhydroxyalcanoates) par des cultures mixtes microbiennes
Guillermina HERNANDEZ-RAQUET et Emilie ALAUX (TBI, Toulouse)

Les peptides antimicrobiens comme nouvel outil thérapeutique contre les infections pulmonaires
Stéphane Canaan (IMM-LISM, Marseille)

Implication des enzymes lipolytiques eucaryotes dans le métabolisme des granules lipidiques par des approches de « Gene silencing »
Stéphane Canaan (IMM-LISM, Marseille)

Coordination of envelope biogenesis in bacteria: coupling of an essential outer membrane assembly machinery with envelope integrity factors
Cécile Albenne, Anne Sarcos et Raffaele Ieva (CBI-LMGM)

Etude du système Xer chez Acinetobacter baumanii
Philippe Rousseau (CBI-LMGM)

Listes des stages proposés en 2018-2019

Gene regulation via Nudix-triggered RNA degradation in Staphylococcus aureusP.
P. Redder (CBI-LMGM, Toulouse)

Emergence des virus influenza aviaires hautement pathogenes
R. Vomer (INRA-ENVT, Toulouse)

Rôle des “Outer Membrane Vesicles” (OMV) sécrétées par les Escherichia coli dans le transport des toxines et molécules bactériennes
F. Taieb (IRSD, Toulouse)

Caractérisation de la réponse immunitaire innée lors de co- infections IDV-BCoV/VRSB chez l’hôte bovin.
A. Lion (INRA-ENVT, Toulouse)

Modulation de la réponse antivirale et pro-inflammatoire par la protéine NS1 des virus influenza D
A. Lion (INRA-ENVT, Toulouse)

Etude par évolution expérimentale en modèle in vitro pré-clinique de la résistance et de la tolérance aux antibiotiques
E. Giraud (INRA-ENVT, Toulouse)

Cystic fibrosis lung organoids : an innovative tool to decipher P. aeruginosa chronic infection. (C. Cougoule, IPBSToulouse)

Le biologie des ARN chez les Archées: Caractérisation biochimique d’une nouvelle ribonucléase putative, RecJSOD, appartenant au réseau d’interaction du complexe aRNase J/ hélicase ASH-Ski2 chez les Thermococcales
B. Clouet d’Orval (CBI-LMGM, Toulouse)

Nouveaux systèmes toxine-antitoxine
P Bordes (CBI-LMGM, Toulouse)

Caractérisation moléculaire et fonctionnelle des vésicules membranaires libérées par les mycobactéries
E. Layre (IPBS, Toulouse)

Etude d'un nouveau type de système de ségrégation de l'ADN
C. Guynet (CBI-LMGM, Toulouse)

Etude de protéines impliquées dans le métabolisme des lipides mycobactériens
N. Thomas & H. Marrakchi (IPBS, Toulouse)

Diversité phénotypique naturelle du cycle cellulaire chez les Escherichia coli
M. Campos (CBI-LMGM, Toulouse)

Identification et caractérisation des déterminants génétiques de la résistance et de la tolérance aux antibiotiques chez le pathogène bactérien Mycobacterium abscessus
K. Cam et C. Chalut (IPBS, Toulouse)

Le complexe Fatty Acid Synthase-II, une cible stratégique pour de nouveaux médicaments contre la tuberculose et les mycobactérioses
A. Quémard et F. Bardou (IPBS, Toulouse)

Metabolic engineering of Escherichia coli for oligosaccharides production
F. Letisse (LISBP, Toulouse)

Etude du mécanisme d’immunité de la protéine HetR réqulant la différenciation cellulaire chez la cyanobactérie Nostoc PCC 7120
A. Latifi (LCB, Marseille)



Liste des stages proposés pour l'année 2017-2018

Etude des mécanismes biophysiques membranaires des facteurs lipidiques de virulence de Mycobacterium tuberculosis 

C. Astarie-Dequeker & E. Haanappel, IPBS

 

Caractérisation de la compétence pour la transformation génétique chez Streptococcus. pneumoniae 

M. Bergé, LMGM

 

Etude du rôle du site centromèrique du plasmide F d’E. coli dans le contrôle des étapes d’auto-assemblage des complexes de partition et de leur ségrégation.

JY Bouet, LMGM

 

Génétique de l’adaptation d’une bactérie phytopathogène aux environnements plante étudiée par une approche TnSeq.

A. Boulanger, LIPM

 

Characterization of Super Chaperonin Mutants

MP Castanié-Cornet, LMGM

 

Le métabolisme des ARN chez les Archées: Caractérisation biochimique du complexe multiprotéique impliquant la  Ribonucléases β-CASP aRNase J et l’ Hélicase à ARN aSki2b

B. Clouet-d’Orval & Marie Bouvier, LMGM

 

Evolution expérimentale de la résistance et de la tolérance aux antibiotiques

E . Giraud, Toxalim (ENVT)

 

Le rôle du Recombination Enhancer dans la conformation du chromosome III de la levure Saccharomyces cerevisiae.

N. Tanguy Le Gac, LBME

 

Etude fonctionnelle in vivo de la protéine Knr4 impliquée dans la résistance au stress et la morphogénèse chez la levure S. cerevisiae.

H. Martin-Yken, LISBP

 

Rôle de l’oxyde nitrique (NO) dans la symbiose fixatrice d’azote Sinorhizobium meliloti-Medicago truncatula : 

E. Meilhoc, LIPM

 

Caractérisation du lien fonctionnel entre Tps1p, protéine clé de l’homéostasie énergétique chez S. cerevisiae, et la machinerie traductionnelle.

JL Parrou & A Henras, LISBP & LBME

 

Gene regulation via Nudix-triggered RNA degradation in Staphylococcus aureus

P. Redder, LMGM

 

Why is the enzymatically non-functional RNase J2 important for gene regulation in Staphylococcus aureus ?

P. Redder, LMGM

 

Étude des voies d'internalisation de la Cytolethal Distending Toxin par les vésicules extracellulaires sécrétées par les Escherichia coli.

F. Taieb, IRSD

 

Implication de l’autophagie des macrophages dans le défaut de viabilité intracellulaire de mutants de Mycobacterium abscessus. 

I. Vergne, IPBS

 

Enzyme engineering for synthetic methylotrophy in E.coli

S. Heux, LISBP METASYS

 

Caractérisation des voies de régulation de l’expression de hlyF chez les Escherichia coli pathogènes.

P. Branchu, IRSD

 

Interactome analysis of the bacterial envelope-assembly machineries: biogenesis and remodelling programs in bacterial pathogens

R. Ieva, LMGM

 

Nouveaux systèmes toxine-antitoxine

P. Bordes, LMGM

 

Coordination des évènements tardifs du cycle cellulaire bactérien

M. Campos ; LMGM

 

Interactome analysis of the bacterial envelope-assembly machineries: biogenesis and remodelling programs in bacterial pathogens 

C. Albenne, LMGM

 

Date de mise à jour 5 mars 2020


 

ETUDIANTS: Choix des Stages


Chaque année, en juillet, une vingtaine de stages sont proposés aux étudiants retenus pour le M2 Microbiologie Moléculaire. Les étudiants doivent alors entrer en contact avec ces laboratoires afin de trouver un accord. La procédure doit être terminée avant septembre pour que l'inscription en M2 soit validée.

En information complémentaire, vous trouverez la liste des stages proposés depuis 2017

LABORATOIRES: Offres de Stage 2018-2019

 

Vous voulez déposer une offre de stage pour le M2 M&M pour l'année universitaire 2018-2019 ?
Il suffit de télécharger la fiche de stage à partir de l'onglet "Offres de Stages".
Une fois remplie envoyez cette fiche  avant le 15 juin 2018 à: philippe.rousseau@ibcg.biotoul.fr 

Université Toulouse III - Paul Sabatier - 118 route de Narbonne 31062 TOULOUSE CEDEX 9 téléphone +33 (0)5 61 55 66 11